مرکز تحقیقات علوم بهداشتی با هدف پژوهش و تحقیق در حیطه های گوناگون علوم بهداشتی تأسیس شده است. مقدمات تشکیل این مرکز در بهمن ماه ۱۳۸۶ پی ریزی شد. در تاریخ ۲۹/۴/۸۷ در جلسه کمیسیون معاونت تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی با تأسیس آن موافقت گردید و در آبانماه ۱۳۸۸ شورای گسترش وزارت متبوع، موافقت اصولی خود را با تأسیس مرکز اعلام نمود. برای اخذ موافقت قطعی، طی نامه ای از سوی ریاست محترم دانشگاه در تاریخ ۸/۷/۸۹ مدارک و مستندات لازم به معاونت تحقیقات و فن آوری وزارت متبوع ارسال و پس از تصویب در آن معاونت، در بهار ۹۰ به شورای گسترش وزارت متبوع ارسال گردید و شورای گسترش وزارت متبوع در جلسه مورخ ۲۹/۹/۹۰ با تاسیس مرکز موافقت قطعی نمود.

نظر به اینکه دانشکده بهداشت مسئولیت پذیرش و تربیت دانشجو در مقاطع مختلف رشته های علوم بهداشتی را برعهده دارد، محل استقرار مرکز در این دانشکده بوده تا اساتید و دانشجویان رشته های مختلف بتوانند پروژه ها و طرح های تحقیقاتی خود را به طور مشترک با این مرکز به انجام برسانند. در راستای تحقق این هدف، تفاهم نامه همکاری های علمی بین مرکز تحقیقات و گروه های مختلف آموزشی دانشکده و حوزه معاونت بهداشتی دانشگاه منعقد شده است. همچنین این مرکز با همکاری مرکز تحقیقات سیاست گذاری سلامت و مرکز تحقیقات ایدز، "پژوهشکده سلامت" را تاسیس کرده و در تاریخ ۱۰/۶/۹۵ موفق به اخذ موافقت اصولی از شورای گسترش وزارت مطبوع گردید.